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分子水平实验(4)

 
详细说明

    甲基化检测服务

实验原理

DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,真核生物中的甲基化仅发生于胞嘧啶,即在DNA甲基化转移酶( DNMTS)的作用下使CpG二核苷酸5~端的胞喀啶转变为5”-甲基胞喀啶。DNA甲基化通常抑制基因表达,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。这种DNA修饰方式在不改变基因序列前提下实现对基因表达的调控。



注:M:甲基化引物PCR扩増;U:非甲基化引物PCR扩増。SW1353细胞在药物处理后从完全甲基化转变为完全非甲基化,OUMS-27细胞在5-Aza-dC处理后从部分甲基化部分非甲基化状态转变为完全非甲基化。

Northern或 Southern Blot检测服务

实验原理

Southern杂交是进行基因组DNA特定序列定位的方法,由 Southern于1975年创建,称为 Southerne印迹技术。其原理为利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线照射固定,再与相对应结构的DG标记探针进行杂交,用放射自显影或酶反应显色,从而检测特定DNA分子的含量。

Northerne印迹杂交( Northern blot)是一种将RNA从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维素膜上的方法,主要利用碱基配对原则,利用特性的DNA探针与其杂交,经过显影技术分析RNA的最和大小。RNA印迹技术正好与DNA相对应,故被称为 Northern印迹杂交,与此原理相似的蛋白质印迹技术则被称为 Western blot



实验流程

a) Northern Blot

1.完整mRNA的分离

2.根据RNA的大小通过琼脂糖凝胶电泳对RNA进行分离

3.将RNA转移到固相支持物上,在转移的过程中,要保持RNA在凝胶中的相对分布

4.将RNA固定到支持物上

5.固相RNA与探针分子杂交

6.除去非特异结合到固相支持物上的探针分子

7.对特异结合的探针分子的图像进行检测、捕获和分析



b)Southern Blot



1、制备待测DNA2、DNA限制酶消化

3、琼脂糖凝胶电泳分离待测DNA样品

4、电泳凝胶预处理

5、转膜

6、探针标记

7、预杂交

8、 Southern杂交

9、洗膜

10、放射性自显影检测

11、实验结果分析及报告

样本要求

1.新鲜组织:

用解剖刀等迅速切成小碎块约30-100mg,放入20mL离心营中开盖液氮速东15min.80度保存,干冰运输。每个northern blot泳道提供2-3管样品。注:解剖刀处理组织的时间尽量控制在1min以内。液氮速冻时必须开盖以防炸裂。

2细胞样品:

县浮细胞1000-1500rpm,5min,常温离心收集细胞。贴壁细胞用胰蛋白酶消化后吹丁收集,PBS洗涤细胞,去除多余培养基和胰蛋白酶。开盖液氮速冻15min,-80度保存干冰运输,一般情况下,细胞培养的6孔板每孔细

 
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